Frank (1 988a) ha reconstruido el sistema consonantal del protochibcha serrano así:  

Compárese este con los inventarios consonantales del kogui, dámana e ika.

Unas de las diferencias más sobresalientes entre el sistema reconstruido y los idiomas descendientes es el desarrollo de alveopalatales y de nasales oclusivas. No obstante, la historia de cada fonema no es tan sencilla como parece. Por ejemplo, cada uno de los idiomas tiene un fomenta /zh/, pero históricamente tiene un origen diferente para cada uno. Por esto tenemos que disponer con cuidado los cambios de sonido ocurridos para llegar a una imagen exacta de cómo los idiomas evolucionaron. Para examinar tanto estas innovaciones como otros cambios de sonido, comenzaremos a observar cómo se desarrolló el kogi aparte del dámana e ika.

Las oclusivas nasales /m/ y /n/ se encuentran en todos los tres idiomas de la Sierra, e históricamente derivan de /b/ y /d/ del proto- chibcha serrano (Frank, 1988), y por consiguiente del /b/ y /d del proto-chibcha también (Costenla, 1981). Para examinar los conjuntos de cognados siguientes del *b proto-chibcha serrano, ya podemos observar una divergencia principal entre kogi, por un lado, y dámana e ika por el otro lado: