En el año de 1633 apareció en Santafé, en las poblaciones de la Sabana y en otras comarcas del Nuevo Reino, una terrible y contagiosa epidemia de tabardillo, nombre con el cual se conocían indistintamente las entidades patológicas que se designan en la nosología actual con las denominaciones de tifo y fiebre tifoidea. En los léxicos castellanos el tabardillo es “fiebre grave, aguda y continua; ll Pintado. El acompañado de manchas en la piel, parecidas a las picaduras de pulga.” Según el distinguido Profesor de medicina, doctor José Félix Merizalde, muerto en 1868, el origen de la palabra tabardillo en castellano, nació de un casacón ancho y largo llamado tabardo, que ponían a los que llevaban a ajusticiar, y que esmaltado de puntas moradas se usó en algunas Provincias de España (14) . 

Con excepción de las epidemias de viruela, ninguna enfermedad contagiosa se había desenvuelto en el sano y dulce clima de la Sabana con tan destructora intensidad. Muchas familias desaparecieron, y sus últimos sobrevivientes, ya sin herederos, otorgaron testamento de sus bienes a favor de Gil, Escribano real público del número, por lo cual se conoce en la historia dicha epidemia con el nombre de peste de Santos Gil.

El Escribano Gil había nacido en España, cerca de Peñafiel; vino al Nuevo Reino como Procurador de Pleitos en Santafé. De su testamento, otorgado en 1639, seis años después de principiada la epidemia, vamos a insertar la fundación de una capellanía de las diez y ocho que dejó fundadas: 

El maestro Gregorio Barbosa con una casa y tienda en la Calle Real, y más otra casa junto a la de Coronado, de que gozase hasta que Juana, niña huérfana que había criado una moza de la casa del fundador, fuese de edad de tomar estado, y si muriese antes, quedase en capellanía con obligación por ambas fincas de ochenta misas rezadas y una cantada, y diez menos faltando la segunda casa, aplicadas por su ánima y la de sus padres.  

Lo transcrito enseña claramente que para entonces no había nomenclatura de calles ni numeración de casas en Santafé, sino que se conocían las habitaciones por el dueño, habitante o vecino. 

Como noticia curiosa recordamos que Santos Gil ordenó que lo enterraran en el umbral de la iglesia de La Concepción, “desnudo de la cintura arriba y con zoga a la garganta y a la cintura, y sin ataúd” (15) . 

El Arzobispo Almansa estaba en Pamplona, adonde le llegó noticia de la epidemia de tabardillo; regresó por tal motivo a Tunja y dispuso que la imagen de la Virgen de Chiquinquirá se trajese en procesión de rogativa a Tunja y luego a Santafé, de donde salieron a recibirla miembros de los Cabildos civil y eclesiástico.

El señor Almansa fue víctima de la epidemia en Tunja, y aunque ya enfermo, lo trasladaron a Villa de Leiva, por creer este lugar de más suave clima; no obstante estos cuidados, falleció el 27 de septiembre de 1633. Su cadáver fue sepultado sin embalsamamiento, por haber muerto de enfermedad contagiosa. “Quedó después de muerto tratable, dice Ocáriz, y con suave olor, siendo la enfermedad de tabardillo de contrario efecto; y se depositó en la peaña del altar mayor de la. parroquial de aquella villa, profundando la sepultura dos estados y echando encima del cuerpo cal viva para que lo consumiera y poderlo trasladar brevemente a su convento de Madrid, como dejó ordenado.” Terminamos las noticias sobre la muerte del señor Almansa recordando que pasado un año abrió la sepultura su albacea Francisco Rincón, y halló el cadáver intacto; sepultólo de nuevo, y en 1635 envió el Cabildo eclesiástico a un Capitular y a un Notario a que lo exhumasen segunda vez. El Notario sentó una diligencia en la cual certificaba que el cadáver del Arzobispo estaba entero, que despedía olor que “asemejaba al que tienen las piñas” y que en su concepto podía trasladarse sin inconveniente. Cerrada de nuevo la tumba, llegó cédula en que se ordenaba se enviase el cuerpo del Arzobispo a España, y sus albaceas designaron para llevarlo al doctor Fernando Fernández de Valenzuela, clérigo, y después fraile de la Cartuja (de cuyo retrato, que se guarda en la capilla de Monserrate, hemos hablado en página anterior), quien lo desenterró y trajo a Santafé, donde se le hicieron pomposas honras fúnebres y se guardaron sus restos por algunos meses en lujoso oratorio, en casa de los Valenzuelas (16) . 

Del Arzobispo Almansa guarda la Catedral un retrato de cuerpo entero y tamaño natural, de muy buen pincel, con esta inscripción: 

El Ilmo. Señor Don Bernardino de Almanza, 9° Arzobispo de Santa Fé. Natural de Lima, hizo sus estudios y pasó su juventud al lado de Santo Toribio de Mogrobejo, con cuyos ejemplos de virtud formó su vida. Prelado tan ilustre por su nacimiento como por su ciencia, y más qve todo por sus virtudes. Tomó posesión del Arzobispado en 1627. Tocóle a este Santo y paciente Prelado lidiar con el Presidente de la Real Audiencia, D. Sanchó Girón, hombre imperioso y vano. Murió en la Villa de Leiva, el 27 de Sbre. de 1633, a los 55 años de edad. Su cadáver se remitió a España en cumplimiento de lo dispuesto en su testamento.  

Este retrato, de cuerpo entero y de tamaño natural, es sin duda de los mejores de la galería de la Metropolitana, y según la autorizada opinión del artista Alberto Urdaneta, no se puede vacilar en atribuirlo a Vásquez.   

Fernando Fernández de Valenzuela, bogotano, presbítero y literato, llevó a España el cadáver del señor Almansa, y lo sepultó en el convento de Santa Clara de Madrid, que el Arzobispo había fundado. El año de 1638, ya cumplida su comisión, el presbítero Valenzuela vistió el hábito de cartujo en el convento del Paular de Segovia, y en la Orden tomó el nombre de Bruno de Valenzuela (17) . 

Un distinguido miembro de la Orden de hospitalarios —Fray Juan de Buenafuente—llegó a Santafé el año de 1603 provisto de real licencia para tomar en nombre de su Orden posesión del hospital que con el nombre de San Pedro había fundado el Arzobispo Barrios en casa de su propiedad situada donde hoy existe la sacristía de la Catedral, de las cuales hizo donación intervivos a la beneficencia pública. El Padre Buenafuente no pudo cumplir la voluntad real porque a ello se opuso el Arzobispo Lobo Guerrero, como patrono de la primera casa de beneficencia, y no fue sino muchos años después, en 1635, por disposición de Felipe III, cuando los frailes de San Juan de Dios se encargaron de la dirección del hospital y lo trasladaron al lugar que ocupa actualmente el de San Juan de Dios, edificio de que hablaremos a su debido tiempo (18) . 

En 1639 llegó a Santafé el doctor Diego Henriquez, médico español, con el honroso título de Protomédico, o sea investido de poder oficial para invigilar a los que ejercieran en el Nuevo Reino las profesiones de medicina, cirugía y farmacia. Fue recibido en la Universidad Tomística cuando celebraba el plantel fiesta por haber ganado un pleito contra la Universidad Javeriana, o sea la de los jesuitas, que había durado ochenta y seis años. Fáciles fueron las funciones del Protomedicato en aquel tiempo, pues no habiendo cátedras de medicina, ni Cuerpo médico, ni botica, quedaban reducidas a permitir el ejercicio de la profesión a algunos curanderos, entre los cuales ocupaba el primer lugar nuestro conocido don Pedro Fernández de Valenzuela, quien por entonces gozaba de fama por haber hecho circular, manuscrito, un trabajo suyo que intituló Tratado de medicina y modelo de curar en estas partes de Indias (19) .